淡水生物多样性
农业污染：一个世界范围内的威胁
目前，全球大约3/4的灌溉农业在发展中世界，预计这个比例到下一世纪初期要增加到9/10。
由于到下一世纪中期，世界人口从60亿将增加到100亿，对于食品供应来说，我们将变得更多地依靠“工业化”农业。这意味着在水和农业化肥方面的需求。在美国，农业已被确定为地表水污染的主要来源，而世界其它地方的证据也表明农业是一个主要的污染源。农业污染是一种“非点状源”的污染，意思是，跟踪其源不可能是一个专门的点，这使之更难监测和控制。在典型的情况下，大多数农业污染物是由于土壤侵蚀所造成的沉积物，其中携带着所吸收的各种化学物质。其次是沉重的滋养物负担，特别是来自作物施肥或动物饲养地的氮和磷。第三是杀虫剂。
由于农业、工业和城市对淡水需求的增加，为减轻其危害而稀释污染物含量的潜力变得愈来愈小。与通过调节方法可能得到控制的点状污染源相比，控制农业污染需要多途径进行，包括教育、建立适当的管理方法、农民的参与和改变土地利用等。
沉积物引起各种各样的问题。混浊阻挡阳光、妨碍藻类和根生性水生植物的生长。沉积物沉淀在砂砾河床上会影响鱼产卵，而在海岸地带的沉积会导致珊瑚礁的死亡。河流和湖床的过量沉积会导致江河泛滥和堵塞。带有磷、金属和持久性有机污染物（POPS）特别影响深海有机体并积累在食物链中，而最终浓缩于包括人类在内的高等食肉动物中。
由于来自肥料和动物排泄物的过量滋养物，农业径流导致地表水的富营养化。这使得藻类和浮游植物繁茂，植物群落变化，较差的鱼种取代了好的鱼种，以及由于腐败生物的增加而引起水的脱氧等。自从绿色革命以来，随着施肥指数级的增加和农业的新近增长，与富营养化相关的问题也将日益突出。
农药的使用是一个特别与近代集约农业相关的问题。在发达国家中一直注意避免使用具有毒性的、长效的和生物积累的农药（如DDT），而转向使用那些迅速分解和对非目标有机体毒性小的农药。但是，在发展中国家中，为了降低成本，为了农化公司的倾销，以及由于缺乏规章，人们仍在寻找许多剧毒性杀虫剂（如POPS）。有毒化学物质在动物脂肪组织中的积累会导致死亡、癌症、损伤、繁殖下降、免疫和激素系统遭受抑制以及遗传破坏等。
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